Pemulihan Kepunahan dan Pelestarian Spesies: Tonggak Baru bagi Kebangkitan Harimau Tasmania

Proyek de-extinction harimau Tasmania yang diumumkan pada tahun 2022 telah mencapai tonggak sejarah baru dalam menghasilkan genom purba dengan kualitas tertinggi, penyuntingan genom marsupial, dan teknologi reproduksi berbantuan (ART) baru untuk marsupial.majumeNT tidak hanya akan mendukung kebangkitan harimau Tasmania (yang telah punah sejak 1936 karena perampasan manusia) tetapi juga akan membantu pelestarian spesies yang terancam punah. Kebangkitan dan pengembalian harimau Tasmania ke habitat aslinya di Tasmania akan memulihkan fungsi ekosistem lokal yang sehat. Kemampuan yang baru diperoleh juga akan membantu pelestarian spesies yang terancam punah.

Genom harimau Tasmania yang baru direkonstruksi, yang panjangnya sekitar 3 miliar basa, merupakan genom purba yang paling lengkap dan berkesinambungan dari semua spesies hingga saat ini. Genom ini disusun hingga ke tingkat kromosom dan diperkirakan >99.9% akurat. Genom ini mencakup fitur berulang yang sulit disusun seperti sentromer dan telomer, yang sulit direkonstruksi bahkan untuk spesies yang masih hidup. Genom ini hanya memiliki 45 celah, yang akan ditutup dengan upaya pengurutan tambahan dalam beberapa bulan mendatang.

Sebagian besar spesimen purba hanya menyimpan sekuens DNA pendek dengan sedikit atau tanpa RNA, akibat degradasi setelah kematian suatu organisme. Genom harimau Tasmania baru ini luar biasa dalam pengawetan sekuens DNA panjang dan RNA yang tidak biasa. RNA terdegradasi jauh lebih cepat sehingga pengawetan RNA jarang terjadi pada sampel historis. Dalam kasus ini, tim peneliti berhasil mengisolasi molekul RNA panjang dari jaringan lunak yang diawetkan dari sampel berusia 110 tahun. Hal ini penting karena ekspresi RNA bervariasi dalam jaringan sehingga keberadaan RNA dalam jaringan memberikan gambaran tentang gen aktif yang diperlukan untuk berfungsinya jaringan dengan baik. Lapisan RNA baru membuat genom harimau Tasmania yang dibangun dari DNA jauh lebih berguna dalam de-extinction.

Setelah merekonstruksi genom harimau Tasmania, langkah logis berikutnya adalah mengidentifikasi gen yang mendasari ciri inti harimau Tasmania berupa rahang dan morfologi tengkorak yang khas. Untuk menentukan hal ini, tim peneliti membandingkan genom harimau Tasmania dengan genom serigala dan anjing dengan bentuk kraniofasial yang serupa dan mengidentifikasi wilayah genom yang disebut "Wolf Accelerated Regions" (TWAR) yang kemudian ditemukan mendorong evolusi bentuk tengkorak pada mamalia.

Setelah terkonfirmasi bahwa TWAR bertanggung jawab atas morfologi kraniofasial, tim peneliti membuat suntingan genetik yang sama yang berjumlah lebih dari 300 ke dalam garis sel dunnart berekor gemuk, yang merupakan kerabat terdekat harimau Tasmania yang masih hidup dan akan menjadi pengganti embrio harimau Tasmania di masa mendatang.

Berikutnya adalah pengembangan teknologi reproduksi berbantuan (ART) untuk spesies Dunnart yang akan menjadi pengganti harimau Tasmania. Sebelum proyek de-extinction harimau Tasmania, hampir tidak ada ART untuk marsupial apa pun. Penelitian ini kini telah mengembangkan teknologi penting untuk menginduksi ovulasi terkendali dari banyak telur secara bersamaan dalam seekor Dunnart. Telur-telur tersebut dapat digunakan untuk membuat embrio baru untuk menampung genom harimau Tasmania yang telah diedit. Para peneliti juga dapat mengambil embrio sel tunggal yang telah dibuahi dan membudidayakannya selama lebih dari setengah masa kehamilan dalam alat rahim buatan. Kemampuan ART yang baru dapat diterapkan di seluruh keluarga marsupial untuk de-extinction harimau Tasmania serta untuk meningkatkan kapasitas pengembangbiakan spesies marsupial yang terancam punah.

Kebangkitan dan pengembalian harimau Tasmania ke habitat aslinya di Tasmania akan memulihkan fungsi ekosistem lokal yang sehat. Kemampuan yang baru diperoleh juga akan membantu dalam pelestarian spesies yang terancam punah.

***

Referensi: